日光温室大棚的土壤是需要消毒的。可以用多菌灵亦或硫氰酸甲酯一比六百的比例，用喷雾的方式去除土壤中遗留的病菌。

大棚的消毒工作，要特别小心注意，首先要保证四周密封，盖紧隔热帘，用百分之四十五的百菌清气雾剂亦或大棚专用熏蒸剂，从里边到外边进行喷雾，然后密封一天后再通风，棚户等通风比较好以后才能进棚里。

育苗盘也是要消毒的。这个过程就比较简单了，就是用适当的液体浸泡然后晾干就行了。

另外，棚户平时可以根据膜下的滴灌来给温室的农作物浇水。如此不只能够很大地改善棚屋的环境，而且还能把湿度把控在比较合适的范畴里，这样就能够维持棚里的温度，降低病菌的滋生蔓延，然后增加农作物的产量。